云范例用外周血血浆肿瘤DNActDNA

北京扁平疣医院医师 http://pf.39.net/bdfyy/bdflx/210421/8872659.html
文章来源于国家中心共建单位中医院，作者：血液所/血液科在读博士主治医师刘为易；博士副主任医师全日城；审校胡晓梅

骨髓增生异常综合征（MDS）是一组起源于造血干/祖细胞的异质性疾病，以骨髓克隆性造血、长期的进行性难治性血细胞减少、高风险向急性髓系白血病（AML）转化为特征。随着二代基因测序（NGS）技术的广泛应用，基因突变等分子生物学标记已经进入MDS的诊疗指南。

传统MDS患者的基因检测主要基于骨髓样本，然而骨髓样本采集具有侵入性，对施术者技术有一定要求、资源要求较高、并且可能伴有与手术相关的并发症。循环肿瘤DNA（ctDNA）检测技术，利用患者外周血作为样本进行检测，被广泛应用于实体瘤，由于ctDNA是由肿瘤细胞释放到血液中的DNA碎片，被称为肿瘤细胞留在血液中的“指纹”。胡晓梅团队从25名MDS患者骨髓和外周血配对的样本中检测骨髓tDNA和外周血血浆tDNA的突变基因，研究发现，在变异等位基因频率（VAF）和体细胞突变中，配对的骨髓tDNA和外周血血浆tDNA之间VAF存在高度一致性（R2=0.，P0.;R2=0.，P0.）。

Figure1.ThecorrelationofVAFinvariantcalls(A-C)andsomaticmutations(D)betweenbonemarrowtumorDNA(BM-tDNA)andperipheralbloodplasmacirculatingtumorDNA(PP-ctDNA)in25pairedsamplesofpatients.Totalvariantcalls(A)includesSNVs(B)andINDELs(C).

胡晓梅团队比较了不同亚型的5名患者骨髓、外周血血浆以及外周血细胞配对样本的tDNA体细胞突变基因，进一步对不同疾病状态的3名患者外周血血浆tDNA突变基因进行动态监测。1例最初诊断为MDS伴原始细胞增多1型（MDS-EB-1）、之后转为AML的患者，不断检测到ASXL1Cfs，U2AF1S34Y，EZH2Afs和SETBP1IT四个体细胞突变，在15月后发现另外的TET2Kfs和RUNX1RQ两个体细胞突变，提示RUNX1和TET2这两个体细胞突变可能与MDS向AML转化有关。研究还显示，外周血血浆tDNA优于用外周血细胞tDNA来替代骨髓tDNA发现体细胞突变,外周血血浆tDNA的多个标记预测了MDS的疾病状态。研究认为，用外周血血浆tDNA检测MDS体细胞突变，在MDS中具有重要的应用价值。胡晓梅团队进一步研究能否用外周血血浆tDNA监测MDS患者对复方青黄散的治疗反应，结果发现，完全缓解患者的突变基因VAF下降至0，稳定患者治疗后骨髓中原始细胞百分比虽未发生改变，但突变基因VAF有明显变化，提示突变基因的VAF可能较骨髓或外周血原始细胞百分比更敏感地反映患者的疾病状态。1例最初被诊断为MDS伴三系病态造血（MDS-MLD）、治疗后疾病稳定的患者，TP53突变保持稳定近14个月，并且病人也处于临床稳定状态，这提示TP53突变可能是复方青黄散治疗的靶标。Figure2.ApplicationofserialperipheralbloodplasmacirculatingtumorDNA(PP-ctDNA)samplestopredictdiseasestatusinthreepatients,includingonepatientdevelopedAML(A,B),onepatientwitheffectevaluatedasSD(C,D),andonepatientwitheffectevaluatedasCR(E,F).胡晓梅团队的研究结果提示，骨髓tDNA与外周血血浆tDNA之间变异等位基因频率和体细胞突变的相关性都很高，在某种程度上，外周血血浆ctDNA基因突变的丰度可以预测MDS疾病状态和和反映患者对复方青黄散的治疗反应。该研究成果在HematologicalOncology发表，该团队根据研究成果自行设计的示意图荣登杂志封面。胡晓梅团队研究成果示意图将荣登杂志封面ZhaoP,QinJ,LiuW,ZhuQ,FanT,XiaoH,WangJ,HuangG,XiaomeiH.UsingcirculatingtumorDNAtomonitormyelodysplasticsyndromesstatus.HematologicalOncology,;37(4):-.预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇

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